Por siglos, diversos grupos de indígenas zoques han visitado esta cueva. 1962 Los biólogos Gordon y Rosen realizan la primera investigación en la cueva, estudiando organismos como peces, insectos, arañas, etcétera.1987 Jim Pisarowicz y Warren Netherton exploran la cueva y realizan un estudio fotográfico de la misma1988 Jim Pisarowicz regresa a realizar un mapa preliminar de la cueva. Se inician las primeras investigaciones en torno a la acides de las formaciones que pendían del techo y las paredes de la cueva, denominadas mocotitas, debido a la notoria capa de moco formada por las bacterias que allí crecen1989 Se llevan a cabo las primeras expediciones para muestrear el ácido sulfúrico contenido en el aire.1992 -1994 Aparecen los primeros resultados del análisis de las muestras colectadas en 1996-1997 Se realizan nuevas expediciones para definir el mapa de la cueva. Durante el viaje de 1996 a1997 se colectan por primera vez muestras de las mocotitas, sedimentos de las paredes, suelo y arroyo, para realizar análisis biológicos e investigación de microbios.1997 Louise Hose y Jim Pisarowicz, en sus estudios de muestras, encuentran colonias de bacterias que crecen en ambientes con bajo pH.1998 Se realiza una expedición interdisciplinaria, que reúne a espelélogos, biólogos, microbiólogos y geólogos, para iniciar estudios detallados sobre la cueva